O Laboratório de Química da ACOS está vocacionado para a análise de azeitona, azeite e bagaço de azeitona. A funcionar desde 2012, está no epicentro da maior região produtora de azeite do país. O Laboratório foi planeado para responder às necessidades das grandes áreas de produção de azeitona da região e para a aferir a qualidade dos azeites produzidos.

O Laboratório da ACOS recebe amostras de azeitona, azeite, bagaço de azeitona e óleo de bagaço de azeitona que poderão ser analisados por métodos rápidos  ou  por  métodos  de  referência  de acordo  com as  necessidades  de  quem  nos  procura. Podem recorrer ao Laboratório de Azeite e Azeitona da ACOS, todos os profissionais ligados ao sector, tanto produtores, como lagares de cooperativas e privados, independentemente de serem ou não associados da ACOS.